如何看懂疾病基因檢測報告?從基因檢測報告中洞悉健康之道

遺傳是指親代表達相應性狀的基因通過無性或有性繁殖傳遞給後代,從而使後代獲得其父母遺傳信息的現象。簡單來說,遺傳就好比父母各自提供一本字典(DNA),這兩本字典將共同指導孩子日後的樣貌、性格、天賦等等。

然而,如果字典出現某種形式的錯誤,如染色體異常、基因突變等,便有可能導致身體錯誤地理解相應的內容,並出現生長和工作上的混亂,最終產生各種異常癥狀,也就是大家熟識的「遺傳病」。

現時疾病基因檢測是一項較成熟的技術,不僅可以幫助被檢者了解自己患上某種疾病的風險,還指導他們可以採取哪些健康管理方案有效降低疾病的發生。那麼,如何看懂疾病基因檢測報告?

1.什麼是遺傳病?遺傳病有哪些類型?

遺傳病,是指由遺傳物質發生改變而引起的或者是由致病基因所控制的疾病,常為先天性的,也可以後天發病。據臨床數據估計,約50%的遺傳病患者在出生時或兒童時期發病,約30%的遺傳病兒童壽命不超過5歲;但也有部分遺傳病要經過幾年甚至幾十年後才出現明顯癥狀。

根據病因不同,遺傳病主要分為:

① 染色體病

染色體病是由於各種原因引起的染色體數目和(或)結構異常的疾病,如唐氏綜合征、愛德華綜合征、小兒貓叫綜合征等。由於染色體上基因眾多,加上基因的多效性,因此這類疾病常涉及多個器官、系統的形態和功能異常。

嚴重者在胚胎早期死亡並自然流產,少數染色體病患者能存活至出生,但常有機體畸形、智力低下、生長發育遲緩和多系統功能障礙等癥狀,常表現為綜合征,故染色體病是一大類嚴重的遺傳病。

現時染色體病並無有效的治療方法,因此通過染色體病的遺傳諮詢和產前診斷預防染色體病尤為重要。

② 單基因遺傳病

單基因遺傳病是由一對等位基因控制而發生的疾病。該病的種類很多,達到9000種以上,但是每一種疾病的患病機率較小且大多屬於罕見病,遺傳規律遵循孟德爾定律。根據患病家系的系譜分析,單基因病可分為5種,包括常染色體顯性遺傳病、常染色體隱性遺傳病、X連鎖顯性遺傳病、X連鎖隱性遺傳病、Y連鎖遺傳病。

③ 多基因遺傳病

多基因遺傳病是遺傳信息通過兩對以上致病基因的累積效應所致的遺傳病,因此與單基因遺傳病相比,多基因遺傳病不是只由遺傳因素決定,而是遺傳因素與環境因素共同起作用。

多基因遺傳病大多屬於常染色體隱性遺傳且一般有家族性傾向,即如果父母中一方患有多基因遺傳病,則子女患病的幾率會比較高,比如多發性結腸息肉、先天性聾啞等。

什麼是遺傳病?遺傳病有哪些類型?

2.常用的疾病基因檢測技術有哪些?

不同的遺傳病由於遺傳物質的缺陷不同,採用的檢測技術也可能不同,醫生需要結合實際情況綜合考慮及選擇。

下面香港基因化驗將簡單介紹目前常用的疾病基因檢測技術有哪些?

1. Sanger測序

現時Sanger測序廣泛應用於已知單基因遺傳病致病基因或熱點致病位點的遺傳檢測。但由於通量有限,常作為致病基因或致病位點明確的單基因遺傳病檢測手段或NGS結果的驗證技術。

2. NGS測序

NGS測序(高通量測序技術)以高輸出量和高解析度為主要特點,能在短時間內完成幾十萬到幾百萬條DNA分子的序列讀取,並解決Sanger測序每次只能一條序列的不足,不僅給醫生及科研人員提供豐富的遺傳學信息,同時還可以大大降低測序費用、縮短測序時間。

3. MLPA技術

MLPA技術主要用於目標片段基因拷貝數改變的檢測,以及用於單核苷酸多態性分析或者單鹼基變異分析,如診斷杜興肌肉營養不良症、脊髓性肌萎縮症、小兒貓叫綜合征、 DiGeorge綜合征等。

常用的疾病基因檢測技術有哪些?

3.如何看懂疾病基因檢測報告?

一般來說,疾病基因檢測報告的主體內容包含:

● 基本信息:受檢人的個人信息和送檢信息,包括姓名、年齡、性別、門診/住院號、簡要病史、送檢科室、送檢醫師、檢測項目、送檢時間、樣本類型、樣本編號等。

● 檢測結果:陽性結果會列出檢測到的基因變異相關信息,陰性結果即為未檢測到。

● 結果說明:對檢測到的基因變異的說明和致病性評級。

● 分析意見:實驗室針對檢測結果給出的初步結論和建議。

● 疾病信息:對於檢出疾病臨床特徵的簡要描述。

拿到疾病基因檢測報告時,該怎麼看?

Step 1 先觀察報告中最核心的內容,即:

a. 基因:哪個基因發生變異。

b. 合子類型:有性生殖生物的雌雄胚子結合後形成新的細胞統稱為合子。根據兩性配子的基因型和基因位置的相同與否,合子可分為:

• 純合:即兩個等位基因相同位置存在相同變異。

• 複合雜合:即兩個等位基因都發生變異,但變異位置不同。

• 雜合:即兩個等位基因只有一個發生變異。

• 半合子:屬於一種特殊情況,如男性的X染色體是沒有等位基因的,當男性X染色體基因發生改變稱為半合子變異。

• 野生型:無基因變異。

c. 疾病名稱:檢測到的基因所對應的臨床疾病。

需注意的是,一個基因通常會對應幾種疾病,而一種疾病也會關聯不同基因

d. 致病性:根據《ACMG遺傳變異分類標準與指南》,變異可劃分為5個等級,分別為致病(Pathogenic)、可能致病(Likely Pathogenic)、意義未明(Uncertain)、可能良性(Likely Benign)和良性(Benign)。

一般來說,結果為Pathogenic或Likely Pathogenic,代表致病的可能性比較大;而Uncertain,則代表,目前來看致病性證據不足,但是不能排除,需要根據臨床進一步核實;而Likely Benign或Benign的位點一般不會放到報告中。

Step 2 留意報告中其他重要內容

a. 染色體位置:即變異在染色體的位置,如chr19:39214722,即變異位置在第19號染色體的第39214722位鹼基。

b. 轉錄本:轉錄本是由一條基因通過轉錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質的成熟的mRNA。由於不痛轉錄本中對同一個位點的描述(包括核苷酸、氨基酸的位置)是不同的,因此報告中會標註出核苷酸、氨基酸位置對應的是具體哪個轉錄本,方便變異位點的查找即核對。

c. 核苷酸改變/氨基酸改變:根據HGVS規則命名的核苷酸變化/氨基酸變化。核苷酸有A、T、C、G四種且有固定的排列順序,如果第211號位置發生改變,即原本的A被C取代,便會寫作:c.211A>C。此外,相應的氨基酸有20種,也有固定的排列,如果第78號位置絲氨酸(S)被酪氨酸(Y)取代了,可以寫作:p.S78Y。

d. 頻率:指該位點在正常人數據庫中的頻率,通常攜帶的頻率越高,致病的可能性就越小。

e. 遺傳方式:常見的是常染色顯性遺傳(AD)、常染色體隱性遺傳(AR)、X連鎖顯性遺傳(XLD)和X連鎖隱性遺傳(XLR)等。

最後,香港基因化驗表示,不同基因檢測中心所提供的報告可能會略有不同,因此上述內容僅供參考。此外,無論報告是陽性結果還是陰性結果,均不能完全確認/排除被檢者100%患(或不患)病,因此,拿到報告後應儘快到醫生處複診,並請臨床醫生進行綜合的診斷。

如何看懂疾病基因檢測報告?

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