查出HPV陽性後，很多女性朋友都會拿著結果找醫生開藥，希望能儘快遠離這個“惱人”的麻煩，但是大多醫生並不會急著開藥，這就使得醫生和患者出現分歧的地方。大部分女性在感染HPV病毒後，身體都會把病毒清除出去，因此發現HPV病毒感染後，最重要就是進行定期檢查，瞭解有無出現宮頸癌病變，在決定下一步的處理方法。
對於細菌，醫學上有很多種抗生素來對抗，但對病毒，醫生一般都沒有任何靈丹妙藥，和感冒病毒一樣，面對HPV病毒沒有有效的藥物治療。一般來說，病毒的致病性、病毒載量和人體抵抗力，這三個條件決定了人體是否感染HPV病毒致病。
不同病毒型別造成疾病情況下的病毒載量不一樣，例如：高危16型和18型HPV病毒，可能很少的病毒載量就會致病；但低危66型HPV病毒，可能需要很大的病毒載量會致病。所以除非出現了肉眼可見病灶或病理證實有病變才需要治療，只是被查出感染HPV病毒，一般醫生都不會進行特定的治療。但高危型HPV的治療可以用干擾素類的即免疫增強劑局部治療。
要治療HPV病毒，最重要還是從預防入手，因此定期做柏氏抹片檢查，有需要可按照醫生的指引進行HPV基因檢測，才是治療HPV病毒的最好方法。此外，各位女性朋友也可接種HPV疫苗預防HPV病毒感染，而為了你另一半的健康，男性同樣需要接種疫苗預防感染。