乙型肝炎疫苗接種後，可刺激免疫系統產生保護性抗體，這種抗體存在於人的體液中，乙肝病毒一旦出現，抗體會立即作用，將其清除，阻止感染，並且不會傷害到肝臟，從而使人體具有預防乙肝的免疫力，以達到預防乙肝感染的目的。
由於接種第一針乙肝疫苗後，只有30%的人產生乙肝表面抗體，而且抗體效果很不穩定，所以一般乙型肝炎需要接種三針。接種第二針後，有90%的人產生抗體；接種第三針後抗體的陽性率可達96%以上，而且抗體效果持續維持在較高水平。乙型肝炎接種時間一般按照0、1、6，也就是接種第一針後第一個月接種第二針，第六個月接種第三針。