1、羊水穿刺
胎兒生活在媽媽肚子里，會被羊水包裹，因此羊水中含有大量的DNA樣本，只要採集胎兒的羊水，再結合父親的DNA，即可進行親子鑒定。
2、胎兒絨毛親子鑒定
絨毛親子鑒定是採集胎兒體表的絨毛樣本，然後通過技術提取，提取出胎兒的DNA樣本，再結合父親的DNA，就可以判斷雙方是否存在血緣關係了。
3、無創DNA親子鑒定
由於羊水穿刺和胎兒絨毛親子鑒定都是侵入式採集方法，對母體及胎兒均有風險，並且需要懷孕至少10周才能進行。而無創DNA親子鑒定方法的取樣方式很簡單，只需要抽取母體的血液，即可進行親子鑒定。
原理：正常情況下，人一共有23對染色，每一對都是兩條，一般都分別來自於父親和母親。檢測的時候只要對一定數量的DNA位點做檢測，如果分別和父母一樣，那麼就是親生的，否則就存在疑問了。如果只有1-2個位點不匹配，就要加做一些位點的檢測，因為有基因突變的可能，3個以上的位點不匹配，基本上就不是親子關係。